Os cientistas do PD-MitoQUANT estão estudando como a degradação da função mitocondrial das células está implicada na doença de Parkinson. As ferramentas desenvolvidas pela SME geneXplain os estão ajudando a fazer isso.
Os
pesquisadores acham que estudar disfunções nas mitocôndrias pode
levar a novos alvos para medicamentos para DP. Imagem de Kateryna Kon
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Os pesquisadores do PD-MitoQUANT acham que estudar essa disfunção pode levar a novos alvos para os medicamentos para DP. A equipe inclui o SME geneXplain, cujos clientes são pesquisadores que precisam entender os processos de regulação gênica (genes ligando e desligando) em diferentes processos biológicos, no estudo de tudo, desde o câncer até a evolução dos peixes. Os pesquisadores do GeneXplain, Dra. Olga Kel-Margoulis, Kamilya Altynbekova e Dr. Alexander Kel explicam seu envolvimento no projeto.
Qual é a contribuição do geneXplain para a busca do projeto para encontrar novos alvos de drogas para a DP?
Somos especializados na reconstrução de mecanismos moleculares de doenças complexas e a doença de Parkinson é um bom exemplo dessa patologia intrincada. Estamos aplicando nossas ferramentas de bioinformática para analisar vários dados '-omics' gerados no consórcio e tentando reconstruir os mecanismos causais que acontecem nessas células e explicar como as vias moleculares são patologicamente alteradas, com nossa atenção focada nas vias que podem levar a, ou pode ser desencadeada por disfunção mitocondrial.
Como resultado dessa análise, revelamos reguladores mestres, que são genes e suas proteínas codificadas que desempenham um papel fundamental nessas vias alteradas. Esses reguladores principais são propostos como alvos de drogas promissores na DP. Nossa hipótese é que a inibição de tais reguladores mestres pode prevenir a alteração patológica das vias envolvidas e restaurar os processos normais nos neurônios.
Que tipo de dados você coletou até agora?
Coletamos em nossos bancos de dados informações detalhadas sobre 700 biomarcadores moleculares relacionados à DP, incluindo biomarcadores causais, correlativos e preventivos, bem como biomarcadores envolvidos no mecanismo de início e progressão da doença.
Entre esses biomarcadores, existem 47 fatores de transcrição que desempenham um papel importante na regulação da expressão desses genes relacionados à DP. Esses genes estão envolvidos em mais de 150 vias metabólicas e de sinalização. Todo esse conhecimento nos permite inferir novas relações entre genes e proteínas envolvidos na patologia da DP e nossa análise leva à descoberta de novas conexões nas vias alteradas da doença.
A análise de tais vias alteradas da doença é absolutamente necessária para atingir os objetivos do projeto, uma vez que tais alterações não podem ser identificadas por ferramentas padrão.
Você pode nos contar mais sobre suas ferramentas de bioinformática?
Nossos algoritmos nos ajudam a chegar mais perto do mecanismo molecular real da doença, tornando nossos alvos potenciais de drogas e previsões de tratamento muito mais precisos e confiáveis. Nossa plataforma computacional, chamada de 'plataforma geneXplain', atualmente inclui mais de 200 ferramentas diferentes de bioinformática e biologia de sistemas e cerca de 100 pipelines complexos. Muitas dessas ferramentas nos ajudarão a atingir os objetivos do projeto.
Nosso objetivo é melhorar constantemente nossas soluções de software e bancos de dados, a fim de fornecer aos nossos clientes o melhor que é possível na modelagem intracelular da patologia estudada. Na verdade, estamos chegando ao ponto em que não apenas pesquisadores, mas também médicos estão se interessando por tais soluções. Começamos a atrair a atenção de médicos nas áreas de doenças complexas como oncologia, doenças neurodegenerativas e autoimunes e nosso novo produto, Genome Enhancer, em breve permitirá que médicos usem sugestões de tratamento produzidas por nossa ferramenta de medicina de precisão, usando inteligência artificial para reconstruir mecanismo molecular da doença para um grupo de pacientes ou para um paciente específico.
Esse fenômeno é explicado pelo maior envolvimento dos médicos nos estudos dos mecanismos moleculares das doenças, devido às terapias direcionadas e ao aumento da disponibilidade de tecnologias ômicas nas clínicas. Temos quase certeza que um dia não serão apenas os pesquisadores que nos perguntarão sobre os detalhes do aprimoramento de nossas ferramentas, mas também os médicos.
De que forma a parceria no IMI é benéfica para a sua empresa?
Qualquer grande projeto de pesquisa, reunindo as melhores competências em um determinado campo, sempre dá uma incrível capacidade de aprender mais, expandir sua visão atual sobre o problema estudado, conhecer novos colegas e se inspirar em suas ideias e planos de aprimoramento das tecnologias disponíveis atualmente. O valor da parceria com a IMI é difícil de superestimar - o projeto de fato oferece habilidades basicamente irrestritas para aplicar tecnologias recém-desenvolvidas em testes clínicos, ajudando as abordagens inovadoras a chegarem à prática médica geral de forma mais rápida e segura. Original em inglês, tradução Google, revisão Hugo. Fonte: Europa Ihi.
