Os cientistas do PD-MitoQUANT estão
estudando como a degradação da função mitocondrial das células
está implicada na doença de Parkinson. As ferramentas desenvolvidas
pela SME geneXplain os estão ajudando a fazer isso.
Os
pesquisadores acham que estudar disfunções nas mitocôndrias pode
levar a novos alvos para medicamentos para DP. Imagem de Kateryna Kon
via Shutterstock
07 January 2022 - A mitocôndria é a parte
geradora de energia de uma célula e parece que na doença de
Parkinson (DP), as mutações nas mitocôndrias das células que
produzem dopamina (chamadas neurônios) fazem com que o fornecimento
de energia seja interrompido. O resultado é que os neurônios
morrem, a produção de dopamina é interrompida e os sintomas da DP
aparecem.
Os pesquisadores do PD-MitoQUANT acham que
estudar essa disfunção pode levar a novos alvos para os
medicamentos para DP. A equipe inclui o SME geneXplain, cujos
clientes são pesquisadores que precisam entender os processos de
regulação gênica (genes ligando e desligando) em diferentes
processos biológicos, no estudo de tudo, desde o câncer até a
evolução dos peixes. Os pesquisadores do GeneXplain, Dra. Olga
Kel-Margoulis, Kamilya Altynbekova e Dr. Alexander Kel explicam seu
envolvimento no projeto.
Qual é a contribuição do
geneXplain para a busca do projeto para encontrar novos alvos de
drogas para a DP?
Somos especializados na reconstrução
de mecanismos moleculares de doenças complexas e a doença de
Parkinson é um bom exemplo dessa patologia intrincada. Estamos
aplicando nossas ferramentas de bioinformática para analisar vários
dados '-omics' gerados no consórcio e tentando reconstruir os
mecanismos causais que acontecem nessas células e explicar como as
vias moleculares são patologicamente alteradas, com nossa atenção
focada nas vias que podem levar a, ou pode ser desencadeada por
disfunção mitocondrial.
Como resultado dessa análise,
revelamos reguladores mestres, que são genes e suas proteínas
codificadas que desempenham um papel fundamental nessas vias
alteradas. Esses reguladores principais são propostos como alvos de
drogas promissores na DP. Nossa hipótese é que a inibição de tais
reguladores mestres pode prevenir a alteração patológica das vias
envolvidas e restaurar os processos normais nos neurônios.
Que
tipo de dados você coletou até agora?
Coletamos em
nossos bancos de dados informações detalhadas sobre 700
biomarcadores moleculares relacionados à DP, incluindo biomarcadores
causais, correlativos e preventivos, bem como biomarcadores
envolvidos no mecanismo de início e progressão da doença.
Entre
esses biomarcadores, existem 47 fatores de transcrição que
desempenham um papel importante na regulação da expressão desses
genes relacionados à DP. Esses genes estão envolvidos em mais de
150 vias metabólicas e de sinalização. Todo esse conhecimento nos
permite inferir novas relações entre genes e proteínas envolvidos
na patologia da DP e nossa análise leva à descoberta de novas
conexões nas vias alteradas da doença.
A análise de
tais vias alteradas da doença é absolutamente necessária para
atingir os objetivos do projeto, uma vez que tais alterações não
podem ser identificadas por ferramentas padrão.
Você
pode nos contar mais sobre suas ferramentas de
bioinformática?
Nossos algoritmos nos ajudam a chegar
mais perto do mecanismo molecular real da doença, tornando nossos
alvos potenciais de drogas e previsões de tratamento muito mais
precisos e confiáveis. Nossa plataforma computacional, chamada de
'plataforma geneXplain', atualmente inclui mais de 200 ferramentas
diferentes de bioinformática e biologia de sistemas e cerca de 100
pipelines complexos. Muitas dessas ferramentas nos ajudarão a
atingir os objetivos do projeto.
Nosso objetivo é
melhorar constantemente nossas soluções de software e bancos de
dados, a fim de fornecer aos nossos clientes o melhor que é possível
na modelagem intracelular da patologia estudada. Na verdade, estamos
chegando ao ponto em que não apenas pesquisadores, mas também
médicos estão se interessando por tais soluções. Começamos a
atrair a atenção de médicos nas áreas de doenças complexas como
oncologia, doenças neurodegenerativas e autoimunes e nosso novo
produto, Genome Enhancer, em breve permitirá que médicos usem
sugestões de tratamento produzidas por nossa ferramenta de medicina
de precisão, usando inteligência artificial para reconstruir
mecanismo molecular da doença para um grupo de pacientes ou para um
paciente específico.
Esse fenômeno é explicado pelo
maior envolvimento dos médicos nos estudos dos mecanismos
moleculares das doenças, devido às terapias direcionadas e ao
aumento da disponibilidade de tecnologias ômicas nas clínicas.
Temos quase certeza que um dia não serão apenas os pesquisadores
que nos perguntarão sobre os detalhes do aprimoramento de nossas
ferramentas, mas também os médicos.
De que forma a
parceria no IMI é benéfica para a sua empresa?
Qualquer
grande projeto de pesquisa, reunindo as melhores competências em um
determinado campo, sempre dá uma incrível capacidade de aprender
mais, expandir sua visão atual sobre o problema estudado, conhecer
novos colegas e se inspirar em suas ideias e planos de aprimoramento
das tecnologias disponíveis atualmente. O valor da parceria com a
IMI é difícil de superestimar - o projeto de fato oferece
habilidades basicamente irrestritas para aplicar tecnologias
recém-desenvolvidas em testes clínicos, ajudando as abordagens
inovadoras a chegarem à prática médica geral de forma mais rápida
e segura. Original em inglês, tradução Google, revisão Hugo.
Fonte:
Europa Ihi.
